Le pélodyte ponctué présente une coloration de fond des parties supérieures verdâtre, brunâtre ou grisâtre, marqué par des ponctuations irrégulières de couleur verte, au niveau des verrues. Ces dernières présentent des glandes saillantes formant des séries longitudinales sinueuses. Les membres sont marqués par des bandes vertes. Les replis dorsaux-latéraux sont bien visibles jusqu'à l’aisselle puis ils s'estompent ou se prolonge de manière discontinue vers l'arrière du corps. Les parties ventrales sont blanchâtre à jaunâtre, uniforme ou rarement tacheté. L'aspect général est élancé, le museau est long et arrondi. La pupille est verticalement ovale et l'iris est doré dans sa partie supérieure et brun dans sa partie inférieure. Le tympan et les glandes parotoïdes sont très discrètes. Les membres sont longs et fins et la palmure est réduite. Les mâles reproducteurs développent des callosités nuptiales brunes sur les deux premiers doigts, le bras, l’avant-bras et la poitrine ainsi que des épines sur le menton, le bas-ventre, les cuisses et les orteils. Le sac vocal est interne.

Le Pélodyte ponctué est présent du niveau de la mer jusqu'à 1 600 m d'altitude dans les Alpes et les Pyrénées. L'espèce occupe préférentiellement des habitats naturels ou artificiels relativement instables d'où le fait qu'il soit parfois qualifié d'espèce "pionnière". On le rencontre depuis les milieux très ouverts jusqu'aux milieux boisés, des plus secs aux plus humides mais toujours pourvues de caches ou d'un substrat meuble propice à l’enfouissement. Le Pélodyte ponctué s'observe dans les prairies, les pelouses, les garrigues et autres formations arbustives, les boisements alluviaux etc. L'espèce s’accommode également d'habitats très modifiés par l'homme comme les zones de labour, les friches, les jachères, les vignobles, ou encore les jardins. Pour se reproduire, le Pélodyte ponctué recherche des milieux ouverts avec des points d’eau temporaires (mais avec une durée d'ennoiement relativement longue), pourvus d'une végétation herbacée ou aquatique abondante, bien exposés au rayonnement solaire et pauvres en espèces piscicoles tels que des mares temporaires, des lagunes, des mouillères, des prairies hygrophiles, des bras morts, des lavognes, des fossés, des flaques etc.). Il tolère une eau légèrement saumâtre. Le gîte comprend des galeries inoccupées de micromammifères, des cavités sous tous type d'élément en contact avec le sol et offrant une protection suffisante (éboulis, bloc rocheux pierrier, divers éléments naturels ou artificiels etc.). L'espèce est également capable de s'enfouir dans le sol lorsque le substrat est suffisamment meuble (jusqu'à 50 cm environ) et des individus ont également été observés en hivernage dans des grottes.

La période d'activité du Pélodyte ponctué s'étend de mi-février à novembre (voire dès janvier en fonction des régions). Elle débute par une période de reproduction qui s'étend de mi-février à avril (rarement jusqu’en mai). Le début de la période d'activité est déclenché par de fortes précipitations et une température minimale de 4°C. Les mâles chantent souvent en cœur dans l'eau en adoptant une position verticale caractéristique. L'amplexus est de type lombaire. La ponte compte jusqu'à 1 600 œufs environ, fractionnés en amas d'une dizaine à plusieurs centaines d’œufs. Les pontes sont fixées en spirale sur un support immergé verticale. Les œufs éclosent généralement 3 à 19 jours après la ponte (ou plus s'il s'agit de pontes tardives) et la métamorphose survient 2 à 4 mois après la ponte.

Bon grimpeur, il est possible d'observer un Pélodyte ponctué perché dans la végétation, parfois jusqu'à 2 m de hauteur.

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